为使各级交通主管部门和交通企业、事业单位内部审计工作科学化、制度化、规范化，根据审计署《关于内审工作的若干规定》第九条，结合交通系统内部审计工作的实际情况，特制定本程序，在各级交通主管部门和各交通企业、事业单位试行。本程序包括：制定审计项目计划、审计实施、审计报告、审计决定、后续审计和审计档案六个部分。实行送达审计或本单位内部进行日常审计工作时，可根据实际工作需要简化审计程序。
各省(区、市)和各单位可依本程序制定实施细则，并报部备案。
一、制定审计项目计划
审计项目，是根据领导批准的年、季度审计工作计划和上级审计部门部署，以及领导临时交办的任务确定的，包括定期审计项目、专项审计项目和临时审计项目。
审计项目计划(表式1)是组织和指导进行审计工作的具体安排，要按审计项目分别制定。一般可分为项目计划大纲和项目实施计划两个层次。
1.审计项目计划大纲。确立每个审计项目的审计目的、范围、内容、方式、起迄时间和项目负责人，并据此下达审计通知书。
2.审计项目实施计划。在已定的计划大纲和对被审单位进行初步调查了解的基础上，制定审计项目实施计划，将该审计项目具体分解为若干分项目，确定每个分项目审计要点、进度、审计方法等。
审计项目计划大纲由单位领导或审计部门负责人审批；审计项目实施计划由审计部门负责人(审计小组负责人)组织制定。
二、审计实施
1.发审计通知
各级审计部门对所属单位实行就地审计时，应根据审计大纲确定的事项发出审计通知书(表式2)。实行送达审计，要明确规定被审计单位报送的资料、报送时间期限等。
审计部门对本单位有关职能部门主管业务进行审计，一般不采用审计通知书形式，可根据单位领导批示或年、季度审计工作安排进行。
2.了解被审计单位基本情况
审计人员应事先对被审计单位的情况进行了解，到达被审计单位后，要听取该单位对生产、经营、管理、效益及与审计项目有关情况的全面介绍，必要时可到当地银行、财政、税务等部门了解被审计单位执行财经制度方面的情况，将主要情况填入被审计单位基本情况表(表式3)。
3.调查审计内容所涉及到的内部控制制度
通过查阅内部控制制度的文件资料，询问及实地考察内部控制制度的执行状况，填制内控制度调查表(表式4)，或绘制内控制度流程图，测试其处理程序、相互关系、职责分工等关键控制点是否符合管理要求，执行是否有效，将薄弱环节作为审计重点。
4.修改审计项目实施计划，进一步明确审计要点、进度、审计方法、人员分工、分项目的负责人等。各分项目负责人还可以制定分项目作业计划。
5.检查取证
按照审计项目实施计划的各分项目审计内容，检查有关的票据、凭证、帐簿、报表，盘点现金、实物，向有关人员询问，参加被审计单位的有关会议，还可随车、船、和到工地、现场进行调查。在上述工作过程中，必须取得详细、真实、合法的审计证据。如：对有关原始资料的复印、复制，现场拍照、录相，同被调查人的谈话记录(表式6)，被调查单位和个人的书面证明材料等，作为反映事实的依据。审计人员应将审计情况和审计证据，记入审计工作记录(表式7)。
对审计工作记录和审计证据，应进行整理、归类并分析其真实性和可靠性。材料不完整、证据手续不齐备的要予以补齐。根据国家法规、上级主管部门和本单位的有关规定，并结合实际情况，评价其合规性、合理性和效益性。
进行上述整理分析后，编写审计工作底稿(表式8)。审计工作底稿是写审计报告的依据，也是对审计工作记录和证据进行系统归类的详细说明。
要一事一稿；审计事实要有依据，并附有必要的审计证据；对问题要揭示其性质和程度；要有分析意见和建议；要经项目负责人核签。
三、审计报告
审计实施完成以后，根据审计工作底稿及有关证据，进行综合分析，写出审计报告。
1.起草审计报告初稿
审计报告的主要内容，应包括被审计单位情况概要、审计范围、内容、工作进程、发现问题、评价和结论、处理意见和建议。审计报告反映问题要实事求是，定性要准确，意见与建议要切实可行。审计报告要经审计人员集体讨论。
2.征求被审计单位意见
审计报告初稿写成以后，须与被审计单位交换意见，在认真听取被审计单位意见后进行修改，再交被审计单位正式提出对审计报告同意与否的书面意见。
3.审定审计报告
审计报告要由项目负责人签章，连同必要的审计工作底稿、证据以及被审计单位的书面意见，一并报审计部门负责人审定。只配一个审计员的单位，审计报告由本单位领导审定。审定时，应充分考虑被审计单位意见。
经审定后的审计报告，要正式下达被审计单位。各级审计部门对所属被审计单位的审计报告可直接(或随同审计决定)下达；对单位内部有关职能部门主管业务的审计报告，可经本单位领导批转下达。重要的审计报告应同时抄报上级审计部门和当地审计机关。
四、审计决定
审计部门对审计报告中需要进行经济处理的问题，应会同有关部门研究后正式作出审计决定，重大的审计决定应报单位领导批准后下达，并抄报上级审计部门和当地审计机关。对违反国家财经法纪情节严重的有关责任人员，应向单位领导另行提出纪律处分的建议；触犯刑律的，由单位提请司法机关依法惩处。
被审计单位接到经审定后的审计报告和审计决定后，对需要处理的问题必须按决定限期执行，并将执行情况书面报告审计部门。如有异议，在十五日内向派出审计人员的单位领导申诉或申请复审。单位领导或上级审计部门在接到申诉或复审申请后，应在三十日内作出处理。申诉(复审)期内，原审计决定照常执行。
五、后续审计
审计部门对重要审计项目，在发出审计报告和审计决定后一定时期(半年至一年)，可以进行后续审计，检查对审计决定的执行情况和效果，提出后续审计报告。若发现新的重大问题，应作为新的审计项目，按程序进行。
六、审计档案
各级审计部门都必须建立档案管理制度，每个审计项目结束后，项目负责人应按照完整、系统的要求，将审计决定、审计报告、被审计单位对审计决定的执行情况和对审计报告的书面意见、被审计单位基本情况表、审计工作底稿、工作记录及审计证据、审计项目计划、审计通知书、被审单位申诉和复审报告等，按审计项目或被审计单位立卷编号存档，并按规定在一定时期移交本单位档案管理部门。
审计项目计划 (表式1)
年 月 日
计单位： 审计方式：
项目： 审计分项目：
审计内容、实施步骤、人员分工：
计划工作时间：
审批部门： 审批人： 项目负责人：
(注：本格式为审计项目计划大纲和审计项目实施计划通用)审计通知书 (表式2)
字第 号
兹指派下列人员对你单位
审行进计，
九 年 月 日开始，预计 天。请给予积极配合，有关资料的准备工作，并提供必要的工作条件。
组长： 职务、职称：
副组长， 职务、职称：
组员：
公 章
年 月 日
(报)：
被审计单位基本情况表 (表式3)
年 月 日
计单位： 性质：
负责人：
单位内部机构、人员、财产、资金情况；生产、经营、主要经济指标他情况：
审核人： 编制人：
内控制度调查表 (表式4)
被审计单位： 年 月 日
(注：标题空格用来注明所调查的内控制度名称) 调查人：
向被审计单位借用资料登记表 (表式5)
年 月 日
注：借用时由借出单位留存，归还时收回归档
调 查 记 录 (表式6)
年 月 日
查人姓名： 工作单位： 职务：
时间： 调查地点：
被调查人签章： 调查人签章：
(通用格式)
年 月 日
计单位：
项目： 审计分项目：
审计员：
被审计单位： (审记凭证、帐簿用)
审计项目： 审计分项目：
月 日
审计员：
(通用格式)
年 月 日
计单位：
事项：
审计事实、审计意见与建议：
复制文件： 份 项目负责人：
证明材料： 份
调查记录： 份
审计工作记录： 份 审 计 员：
被审计单位：
审计事项： 年
月 日
项目负责人： 审计员：
调整科目：指原使用科目和按审计意见使用科目)
